拖车报关的第一步，要准备深圳集装箱运输的前期工作以及派车到外贸客户指定的地点装货。
1.拖车行拿到舱单SO（S/O通常认为是Shipping order的缩写或简称，可以理解为装运通知书、装运指示、订舱确认书等｝，拖车行拿SO，在船东指定码头代理打单。
2.拖车提柜后到达工厂，装货前要检查集装箱，是否有损坏，有污渍或者难闻的气味，如发现以上的情况，需要告知船东，以防止在货物装完后船东进行追责。
3.检查集装箱的柜号，和封条号，在装柜结束后，要检查封条是否锁紧，封条位置是否准确。
4.装完柜后，可要求司机对货物进行过磅，这样重量相对更准确。
拖车报关流程二：重柜还码头
拖车装完货之后，将集装箱拉回码头，还重即可。
拖车报关流程三：报关
1.拖车还重之后，通常都可以报关，报关的截关时间，以SO为准。
2.将单证一套资料交给报关行，报关单、装箱单、发票和合同等 。
3.拿到报关行的名称和海关代码，即可进行电子委托。
4.报关行向海关申报。
5.报关放行。
深圳集装箱运输的主要优点。
(1)跨运车一机完成多种作业(包括自取、搬运、堆垛、装卸车辆等)，减少码头的机种和数量，便于组织管理;
(2)跨运车机动灵活、对位快，岸边装卸桥只需将集装箱卸在码头前沿，无需准确对位，跨运车自行抓取运走， 充分发挥岸边集装箱装卸桥的效率;
(3)机动性强，既能搬运又能堆码，减少作业环节;
(4)堆场的利用率较高，所需的场地面积较小。
如果客户要求到现场进行监装，也是可以的，代理跟仓库提前说好就行，装箱后，下一步就等码头受理了，码头受理后，深圳集装箱运输车队就会把箱子送到码头，再等吊机把柜子吊上船就行。
上海有两个码头，外港和洋山，船如果靠泊外港，且需要船边直装，危库受理后，车队就会把箱子先送到洋山危库（海关监管),再等码头受理，送到港口，大部分都是晚上送港，大部分船也是晚上靠泊。船如果靠泊洋山，且需要船边直装，柜子是不需要进洋山危库的，等码头受理，直接拉到港口去，这个是需要注意。
无论外港还是洋山，码头受理后，就必须按时送到港口去，不能去太晚了，就算你码头放行了，你的仓位也会被别人填补，你的货就上不了船，危险品货物上不了船，会非常麻烦，会需要删单，退关，重新报关等一系列的事情处理。
工厂把货送到货运代理指定的仓库，代理会提前把进仓单发给客户，上面有进仓编码，深圳集装箱运输仓库位置，联系人和电话等信息。根据客户的装箱要求来进行装箱，是否打托，贴危标，贴唛头，缠膜，加固等。如果等装箱后再提出要求，就会产生掏箱费，费时费力，不划算。
一般来说，报关商检，封关放行的最小单位是集装箱，如果要想顺利放行，深圳集装箱运输就要保证这一箱货物都没有问题，并且单据齐全。在整箱海运的时候，由于一箱货物都是自己公司的，因此只要自己的单据提交齐全，办妥相关手续和征收相关税费后很快就能通关放行了。而拼箱货物由于是很多公司的货物堆放在一起，因此一定要所有公司的单据都提交完成才行。有的时候其他的货主提交单据过慢，还会导致自己的货物被卡关，浪费了时间，影响到自己的货物放行，有时候还会牵连自己的的货物一起被甩，对货主造成损失。
深圳集装箱运输进口程序：
１、货运单证：凭出口港寄来的有关货运单证着手安排工作
２、分发单证：将单证分别送代理集装箱货运站和集装箱堆场
３、到货通知：通知收货人有关船舶到港时间，便于准备接货，并于船舶到港以后，发出到货通知
４、提单：收货人按到货通知持正本提单向船公司换取提货单
５、提货单：船公司核对正本提单无讹后，即签发提货单
６、提货：收货人凭提货单连同进口许可证至集装箱堆场办理提箱或提货手续
７、整箱交：集装箱堆场根据提货单交收货人集装箱并与货方代表办理设备交接单手续
８、拼箱交：集装箱货运站凭提单交货
