对于内地的货主来说，整箱海运显然更符合他们的心意。因为珠三角集装箱运输整箱海运可以直接在内地口岸装箱，而拼箱货物则要根据货代公司的安排进行装箱。由于内地口岸的货源少，沿海口岸货源多，因此常常要把货物运到沿海口岸完成装箱，增加了货主的工作。同时，根据我国的相关规定，出口货物必须通过生产所在地和出口报关所在地的商检局检验。因此，如果是整箱货物，本地报关，只需要进行一次商检，而拼箱货物经常是异地报关，就需要经过两次商检。增加了商检次数，给货主带来了麻烦。
珠三角集装箱运输进口程序：
１、货运单证：凭出口港寄来的有关货运单证着手安排工作
２、分发单证：将单证分别送代理集装箱货运站和集装箱堆场
３、到货通知：通知收货人有关船舶到港时间，便于准备接货，并于船舶到港以后，发出到货通知
４、提单：收货人按到货通知持正本提单向船公司换取提货单
５、提货单：船公司核对正本提单无讹后，即签发提货单
６、提货：收货人凭提货单连同进口许可证至集装箱堆场办理提箱或提货手续
７、整箱交：集装箱堆场根据提货单交收货人集装箱并与货方代表办理设备交接单手续
８、拼箱交：集装箱货运站凭提单交货
整箱海运更受欢迎的原因，很大一部分是因为拼箱海运的限制太多了。珠三角集装箱运输在订舱的时候，整箱货物直接可以直接向船公司订舱，但是拼箱货物却一定要向货代公司进行订货，再由货代公司来向船公司进行订舱。而且整箱海运可以指定船公司，但是拼箱货物由于要考虑的因素有很多，如果运输的时候还指定船公司，就会影响自己的货物出运速度。因此，总的来说，拼箱海运对货代公司的要求高，整个操作流程也比较复杂，所以在进行国际货物运输的时候，货主还是更加倾向于使用整箱海运。
码头的前沿采用岸边集装箱装卸桥承担船舶的装卸作业，进口集装箱由装卸桥直接卸到底盘车上，珠三角集装箱运输将载有集装箱的底盘车拖到堆场停放，出场时集装箱牵引车将载有集装箱的底盘车从堆场上直接拖出港区。出口集装箱由集装箱牵引车将载有集装箱的底盘车从港区停放在堆场上，装船时再由集装箱牵引车将载有集装箱的底盘车从堆场拖到码头前沿，由岸边集装箱装卸桥将箱吊装上船。该系统的主要特点是，集装箱在码头堆场的整个停留期间均放置在底盘车上。
珠三角集装箱运输费用：
（A）费用构成：
１、整箱/整箱：装港拖箱费+码头操作费+运费+卸港码头操作费+拖箱费
２、整箱/拼箱：船公司提供的拖箱费+码头操作费+运费+拆箱费
３、拼箱/拼箱：装箱费+运费+拆箱费
４、拼箱/整箱：装箱费+运费+码头操作费+船公司提供的拖箱费
（B）运费：
１、包箱费率：以每个集装箱为计费单位，据中国远洋运输公司使用的交通部《中国远洋货运运价本》 有以下3种包箱费率
Ａ、FAK包箱费率。即对每一集装箱不分货类统一收取的费率
Ｂ、FCS包箱费率。按不同货物等级制定的包箱费率。货物等级也是1~20级，但级差较小。一般低价货费 率高于传统运输费率，高价货则低于传统费率；同一等级货物，实重货运价高于体积货运价
Ｃ、FCB包箱费率。既按不同货物等级或货类，又按计算标准制定的费率。同一级费率因计算标准不同，费率也不同。
２、最低运费方式。
Ａ、规定最低运费等级。如中远公司规定以７级货为最低收费等级，低于7级货均按7级收费
Ｂ、规定最低运费吨。如远东航运公司规定，20英尺箱最低运费吨实重货为17.5吨，尺码货为21.5立方 米，W/M/为21.5运费吨
Ｃ、规定最低箱载利用率
３、最高运费方式
Ａ、规定最高计费吨
如在货物体积超过集装箱通常载货容积时，仍按标准体积收费。若按等级包箱费 率计费，而箱内等级不同时，则可免较低货物等级的运费。
Ｂ、规定最高计费等级。不高于该货物等级的货物，均以规定的最高计费等级收费。
